宝清县第二高级中学始建于2000年8月，学校占地面积66,000平方米，建筑面积18,832平方米。现有教职员工178 人，其中，一线教师145 人，高级教师55人，市级学科带头人、骨干教师 36 人，省级骨干教师、教学能手 8 人;有教学班48个，在校生2，465人。
学校从2005年开始，连续5年高考成绩居双鸭山市四县四区同级同类学校之首，教育教学质量迅速攀升，在双鸭山地区乃至省全省打响了宝清二高教育品牌。从纵向看，建校10年来，学校已经实现了高效、快速、超前的发展目标;从横向看，7届高考，学校已经成为享誉双鸭山地区的知名学校;从考生质量上看，已经呈现出文理同步强劲上升的势头;从学科成绩上看，团队意识、团队精神得到了弘扬光大，夯实了专业引领的基础;从教师队伍上看，中青年骨干教师队伍不断壮大，为宝清二高教育全面崛起积蓄了后发优势。
有付出就有回报，有耕耘就有收获。学校先后荣获省教育教学先进集体、省文明单位、省依法治校示范校、省德育先进集体、省“三育人”先进集体、省安全文明校园、省“百万青少年上冰雪”活动先进学校、省花园式单位、省爱国卫生先进单位、省“群众口碑最佳单位”、“百姓三满意学校” 、省金牌服务单位、省师德建设先进单位、省心理工作先进单位、市教育教学工作先进集体、市德育名校、市师德师风建设先进集体等一系列荣誉称号，省报、市报多次报道了学校的先进事迹。宝清二高正朝着“加强师德师风建设，争创龙江东部地区一流名校，全面提升教育教学质量”的宏伟目标阔步前进!
2003年，首届毕业生参加高考，米振华考入清华大学;2004年，徐敬鹏考入北京大学;2005年，靳国瑞摘取了双鸭山市理科状元的桂冠;2006年，李爽摘取了双鸭山市文科状元的桂冠，并考入北京大学;2007年，全校600分以上的考生同饶河、友谊、集贤三县4校的考生持平;2008年，学校有3名学生跻身全市文、理科前10名，摘取了县文、理科状元的桂冠，600分以上高分段考生比饶河、友谊、集贤三县4校考生还多2人，全县理科前10名我校占7人，全县文科前10名我校占8人，特别是丁武文同学以全市第二名的成绩考入清华大学;2009年，全校高考重本上线107人，二表以上上线人数达452人，马文霄荣获双鸭山市文科高考状元，600分以上考生比饶河、友谊、集贤三县四校总和多5人，并有6名学生跻身全市文、理科前10名，摘取了县文科、理科状元的桂冠，全县理科前10名我校占8人，全县文科前10名我校占6人。2010年高考中，王琪琪同学以642总分考入对外贸易与经济大学2013年高考中，吴婧男同学以总分675考取双鸭山市理科状元，并进入全球排名37的香港中文大学。2020年12月，获评2019-2020年节约型公共机构示范单位。