嘉兴市第三中学建校于1928年，前身系意大利天主教会创办的“明德女子中学”， 1951年7月，更名为私立明德初级中学，开始“扩充名额，男女兼收”。1952年被命名为“嘉兴三中”，校址在中山路134号(现为旭辉广场)。2002年8月，学校搬迁到环城南路611号(现为嘉兴实验初级中学教育集团)，并于2004年开始初高中分离;三中初中和原洪波中学初中组建成“嘉兴实验初级中学”，三中高中部成为“嘉兴市第三中学”。2009年8月，嘉兴市第三中学搬迁至嘉兴市双溪路1922号高中园区内，占地155亩。
学校自创办以来，培养学生三万余人，校友遍布世界各地，各行各业，他们中有：西湖大学教授、副校长、遗传学家许田，知名商人、加拿大女皇金禧勋章获得者詹建龙，北京法国电信研发中心的首席执行官王海拉，中国十大服装设计师祁刚，书画家凌加春，全运会双冠王赵婧等。
在九十年时代风雨变迁中，学校求生存、求发展、求创新，创造了一次次的辉煌。1980年学校被定为嘉兴县重点中学，2004年秋被评为浙江省三级重点高中，2007年春顺利晋升为浙江省二级重点高中。2011年4月，正式挂牌嘉兴教育学院实验中学。2012年1月，被评为浙江省文明单位。2015年9月，被评为浙江省二级普通高中特色示范学校。此外，学校还是浙江省体育特色学校，浙江省新课程样本学校。
学校拥有一支高素质的教师队伍，教职员工139人，专任教师131人，专任教师中具有高级职称62人，中高级教师占教师总数的83.2%，其中有省“春蚕奖”获得者3人，嘉兴市新世纪专业技术带头人1名，嘉兴市级名师1人，嘉兴市学科带头人2人，嘉兴市劳模1人，嘉兴市十大杰出青年1人，嘉兴市“十佳班主任”1名，嘉兴市级德育先进8人，嘉兴市属级学科带头人等骨干教师40多人。学校现有32个行政班。
学校紧紧围绕“明德.健康”的培养目标，以“明志厚德”为基，“发展青年身心，培育优良秉性”，培养学生“明德的高尚品格，健康的身体素质，健康的心理状态，健康的智能活动，健康的审美感受，健康的生活情趣”，致力实现“满足学生有个性地健康发展”的办学理念。在浙江省深化课程改革的广阔背景下，学校构建了特色鲜明的“必修课+明德五健选修课”的课程体系，实现“明德五健，健康发展” 的育人模式转变，满足学生多样化、个性化选择学习的需要，为学生的科学成才创造了多元发展的平台。新课程改革以来的历年高考，学校均取得“家长满意、学生满意、同行认可”的好成绩。多年来，学校在积极营造文化氛围的同时，以“教育要面向世界”的博大视野，与韩国、日本、英国的学校保持积极的校级交流，并与新西兰南地女子中学、南地男子中学结为友好学校。学校积极推进现代学校制度改革，教育内涵不断丰富，教育管理不断科学，教学质量稳步提升。厚重的文化历史承载着现代教育的文明，先进的育人理念演绎着莘莘学子的精彩，“高质量、有特色的百年名校”是嘉兴三中不懈的追求。
“喜看稻菽千重浪，遍地英雄下夕烟” ，一所底蕴深厚的学校才会酝酿出特色鲜明的文化，一方文化浓郁的土壤注定收获色彩绚丽的硕果，三中的明天自有我们更多的期待。