凉州区金山镇九年制学校的前身是建于1958年的金山公社红星小学，1972年，学校随金山公社革委会搬迁至炭山村二组，1983年更名为金山乡中学，1986年小学部分离另成立金山乡炭山小学，学校成为独立初中。2006年，炭山小学并入，学校改名为金山乡九年一贯制学校。2009年至2015年，辖区内其他5所小学先后并入，2018年随着撤乡改镇，学校更名为凉州区金山镇九年制学校。
2022年，根据凉州区生态避险搬迁政策和金山镇集中收缩安置新民居示范点发展需求，在金山镇金山社区建设金山镇九年制学校新校址。新校址总用地面积14931平方米(约22.4亩)，校舍总建筑面积2454.93平方米。2023年8月，学校正式迁往新校址办学。
凉州区金山镇九年制学校现有教学班9个，在校学生202人，在职教师31人，是金山镇唯一的义务教育阶段学校。多年来，学校始终秉承阳光育人、和谐发展的办学思路，严格贯彻落实党的教育方针，坚持立德树人根本任务，全校教职工安贫乐教、甘于奉献，学生踏实学习、自信自强，近几年教学质量始终位居全区农村学校前列。学校注重学生全面发展，葫芦丝、少儿舞蹈、足球等社团活动初见成效，尤其是足球运动成为学校特色。学校连续多年被凉州区教育局评为先进集体。