2014年3月31日，宁波科学中学(宁波镇海中学杭州湾分校)正式获得宁波市教育局批准。该校办学类型为全日制完全中学教育，学校类型为民办学校。
宁波科学中学，是目前国内第二所冠以“科学”名称的宁波市市级学校，部分面向全大市招生。学校将充分利用新区在科技水平、创新能力等方面的优势，坚持特色办学，以科学精神为引领，以科学探究为特色，不断提升学生的创新精神、科学素养和探究能力、实践能力，将学生培养成为全面健康发展、具有科学精神的创新型学生。
2013年11月，宁波杭州湾新区与宁波镇海中学签订合作办学协议，创办镇海中学杭州湾分校。宁波科学中学将与镇海中学杭州湾分校实行两块牌子、一套班子和师资运行管理。宁波科学中学(镇海中学杭州湾分校)将秉承镇海中学培养“综合素质强，个性特长优，学业水平高，社会贡献大的优秀公民”的办学目标，充分发挥镇海中学在市内外的影响力以及先进的教育管理经验，积极推进素质教育，不断提高教育质量，立志办成一所市内外有影响力的品牌学校。
宁波科学中学(镇海中学杭州湾分校)初中部将于2014年9月先行招生，具体招生政策和招生规模在征求各方意见后，将于2014年4月上中旬确定公布。
2012年6月，经招商引校，宁波杭州湾新区与湖北黄冈中学签订了合作办学的框架协议，原计划于2014年秋季正式开学。因学校离正式开学尚有一段时间，当时未就办学模式、招生细则作进一步明确。在后续筹备过程中，双方认识到在各省高考自主化命题制度下，省外学校在浙江办学不可避免会在办学理念、教材、师资及招生范围上面临很多困难。为使新引进中学能够更好适应本土教育，并确保2014年秋季能够如期开学，在市政府及市教育局的大力支持下，新区管委会综合考虑社会认知度、贴近地方实际及长远可持续发展等因素，于2013年11月与镇海中学就举办宁波科学中学(镇海中学杭州湾分校)达成了合作协议。同时，与黄冈中学友好协商，双方同意中止办学合作。
宁波科学中学(镇海中学杭州湾分校)2014年初中部将先行招生，目前已基本具备今年9月正式开学的条件。在保证学校品牌和质量的前提下，该学校将对世纪城业主子女实行一定的优惠招生政策。为保证达不到宁波科学中学(镇海中学杭州湾分校)录取要求的新城区学生也能享受到名校教育资源，管委会商请镇海中学同时协办杭州湾新区初级中学.该校与宁波科学中学(镇海中学杭州湾分校)实施两块牌子、一套班子、一套教师管理的教学模式，符合法定义务教育条件的新城区学生均可入学。设想通过镇海中学的带动和优质师资的引进，把杭州湾初级中学办成为全市有较高影响力的优质学校。该校也将于今年秋季开始招生。